在日常生產過程中，開動磷酸鐵鋰噴霧干燥機前應進行必要的準備工作。首先檢查各個裝置的軸承和密封部分連接處有無松動，各個機械部件的潤滑油狀況以及各個水、風、漿管閥口等是否處于所需位置。然后接通電源檢查電壓和儀表是否正常，最后檢查料漿攪拌桶內料漿的量以及濃度等情況，若出現問題應及時排除。
隨后依次開啟送風機、抽風機，接著打開加熱開關開始升溫。當出料口溫度達到設定溫度時(一般為130℃左右)，啟動料泵和除塵系統。當泵壓達到2MPa后，打開噴槍開始造粒。噴霧干燥設備運行后，應及時觀察霧化情況及料泵工作狀況，若出現堵槍現象需立即清洗或更換噴嘴。噴霧干燥設備正常運行后，還應定時收料、定時檢查各系統運行情況，記錄各工藝參數，并注意清理振動過濾篩。
造粒結束時，應首先關停加熱裝置，停止燃氣機運行。然后關閉噴槍閥門，更換噴槍，擰下噴嘴并沖洗干凈。當進口溫度減低到100℃以下后可以停止送風機和抽風機的運行。接著清理干燥塔和除塵器內余料，關閉除塵器及氣錘，最后關閉總電源，完成生產操作。
如遇緊急情況，必須立即關停噴霧干燥設備，應首先關停送風機和料泵。如果突遇停電，應拉出燃氣機，使塔體自然降溫，然后打開排污閥，排盡料漿管道內漿料，并清洗噴霧干燥設備。